Le dépôt des données

Publié le 26 avril 2017

Où déposer ses données ?

Dans un entrepôt de données. Un entrepôt permet de stocker des données de recherche, d’y accéder et de les réutiliser. Il existe des milliers d’entrepôts répartis en plusieurs types : disciplinaires, multidisciplinaires, propres à un éditeur, institutionnels, spécifiques d’un projet de recherche…
Alors, comment trouver le bon entrepôt ?

1) Suivez les recommandations

Un entrepôt vous est recommandé par l’une des parties prenantes de votre projet (votre financeur, éditeur, institution, etc.) ?

Exemple

En génomique, la communauté scientifique utilise notamment Unitprot ou GenBank comme base de référence.

    • Vos travaux de recherche rentrent dans le cadre d’un projet national ou international ?
      Exemple : la politique de données du programme de recherche international MERMeX stipule que les données collectées seront recueillies dans MISTRALS database pour améliorer, faciliter et sécuriser leur disponibilité.
    • Votre institution s’organise par rapport au dépôt des données ?
      Exemple : l’Institut Laue-Langevin a mis en place une politique de partage des données et dispose d’un portail dans lequel les chercheurs de l’institut peuvent déposer leurs données.
    • Il existe des pratiques spécifiques à votre domaine scientifique ?
      Exemple: en génomique, les bases de données comme UniprotGenBank sont aujourd’hui des bases de référence.
    • Votre éditeur a une politique concernant le partage des données ?
      Exemple: l’éditeur PLOS ONE oblige les auteurs d’un article à rendre accessibles toutes les données sous-jacentes aux résultats rapportés dans l’article soumis.
    • Votre financeur vous donne des recommandations ?
      Exemple : la Commission Européenne donne des lignes directrices aux chercheurs bénéficiant de financement dans le cadre d’Horizon 2020. Les bénéficiaires doivent déposer les données nécessaires à la validation des résultats présentés dans les publications et les autres données citées dans le plan de gestion des données. Le choix de l’entrepôt reste du ressort du déposant (l’annuaire re3dataest recommandé et l’entrepôt Zenodo est également cité).

2) Filtrez par critères

Aucun entrepôt ne vous est recommandé ? Il vous faut donc en trouver un adapté à vos besoins.

Souhaitez-vous un entrepôt ciblé sur votre discipline ? Est-ce que l’entrepôt accepte les formats de vos fichiers ? etc.

    • Quels types de données sont acceptés par l’entrepôt ?
    • Quels formats sont acceptés ?
    • Pourrez-vous modifier les données déposées et accéder aux anciennes versions ?
    • L’entrepôt vous permet-il de restreindre l’accès à vos données ? De mettre un embargo ?
    • Propose-t-il un lien entre les données et les publications associées ?
    • Attribue-t-il un identifiant pérenne aux données ?
    • Impose-t-il une licence ? Vous convient-elle ?
    • Quel type d’entrepôt privilégieriez-vous ? Disciplinaire ? Multidisciplinaire ? Certifié ?
    • Souhaitez-vous que l’entrepôt s’engage à préserver l’accès aux données sur le long terme ?
    • Souhaitez-vous que l’hébergement du serveur de l’entrepôt soit localisé en France ?
    • Y a-t-il un coût pour le dépôt ?
    • Le site est-il simple d’utilisation ? Y a-t-il des aides proposées ?
    • Y a-t-il des statistiques d’utilisation, de consultation, de téléchargement ?

    Les réponses à ces questions peuvent être trouvées sur les pages de politique des entrepôts ou être filtrées dans des annuaires d’entrepôt.

Le saviez-vous ?

Il existe des annuaires (ou répertoires) qui peuvent vous aider à filtrer votre recherche d’entrepôt : re3data, OAD, OpenDOAR, etc.

Comment déposer ses données ?

3) Vérifiez vos données

En effet, une préparation préalable de vos données est nécessaire pour pouvoir les déposer dans de bonnes conditions.

Vous avez choisi une licence de diffusion de vos données, anonymisé les données à caractère personnel, etc.

  • √ Les principes éthiques sont respectés

    √ Les fichiers sont organisés et nommés de façon explicite

    √ Les modalités d’accès sont définies

    √ Une licence est attribuée aux données

    √ Le volume des fichiers ne dépasse pas la taille maximale

    √ Les droits de diffusion sont vérifiés

    √ Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts

    √ Les jeux de données à partager sont sélectionnés

    √ Les données sont décrites et documentées

    √ Un identifiant pérenne et unique est attribué

4) Remplissez le formulaire de dépôt

Quand tout est prêt, connectez-vous sur le site de l’entrepôt, remplissez le formulaire de dépôt et exportez vos fichiers.

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